Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms