Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms