Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sox13Q04891 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms