Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox8Q04886 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms