Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Thbs2Q03350 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms