Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epha4Q03137 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms