Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cacna1cQ01815 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms