Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HmgcrQ01237 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms