Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms