Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms