Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa1Q00623 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms