Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PgrQ00175 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PgrQ00175 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms