Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cmklr1P97468 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms