Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nbr1P97432 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nbr1P97432 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms