Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H3f3aP84244 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms