Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rad54lP70270 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rad54lP70270 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms