Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkacbP68181 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms