Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Barhl1P63157 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Barhl1P63157 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms