Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps28P62858 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps28P62858 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps28P62858 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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