Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps4xP62702 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps4xP62702 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms