Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Copz1P61924 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copz1P61924 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms