Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psme3P61290 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psme3P61290 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms