Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr2fP61219 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr2fP61219 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms