Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Polr2iP60898 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms