Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ActbP60710 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ActbP60710 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ActbP60710 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ActbP60710 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ActbP60710 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ActbP60710 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ActbP60710 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ActbP60710 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ActbP60710 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ActbP60710 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ActbP60710 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ActbP60710 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ActbP60710 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ActbP60710 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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