Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scarf2P59222 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scarf2P59222 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms