Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P58686 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P58686 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P58686 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P58686 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P58686 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P58686 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P58686 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P58686 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P58686 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P58686 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P58686 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms