Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samsn1P57725 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms