Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cox7bP56393 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox7bP56393 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms