Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atp5eP56382 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5eP56382 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms