Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp1P55194 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Sh3bp1P55194 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp1P55194 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Sh3bp1P55194 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Sh3bp1P55194 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Sh3bp1P55194 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms