Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GemP55041 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GemP55041 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GemP55041 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GemP55041 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GemP55041 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GemP55041 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GemP55041 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GemP55041 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GemP55041 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GemP55041 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GemP55041 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GemP55041 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GemP55041 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GemP55041 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GemP55041 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms