Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrlP54846 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrlP54846 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrlP54846 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NrlP54846 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NrlP54846 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NrlP54846 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms