Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Upp1P52624 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Upp1P52624 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Upp1P52624 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms