Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccr4P51680 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms