Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1swP51491 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms