Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csrp3P50462 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csrp3P50462 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms