Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma2P49722 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma2P49722 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms