Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf4P43488 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf4P43488 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms