Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox7P40646 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox7P40646 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms