Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtlP38585 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtlP38585 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtlP38585 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TtlP38585 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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TtlP38585 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtlP38585 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtlP38585 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TtlP38585 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms