Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab17P35292 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab17P35292 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab17P35292 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms