Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms