Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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