Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Saa4P31532 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Saa4P31532 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Saa4P31532 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Saa4P31532 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Saa4P31532 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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