Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPS1P31327 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPS1P31327 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPS1P31327 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPS1P31327 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPS1P31327 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPS1P31327 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms