Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjc1P28229 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjc1P28229 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms