Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-DMaP28078 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms