Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabrg3P27681 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabrg3P27681 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms