Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xrcc5P27641 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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